企业单位在申报季度财务报表时，申报流程为，首先打开电子税务局网页，输入用户名和登录密码后进行申报界面，点击财务报表申报选项，其次点击申报初始化，第三，依次点击资产负债表、损益表、现金流量表，然后填入数据，第四，完成数据填报后，点击提交即可完成申报。