这个问题是这样的，医院直签的一般是正式的劳动合同制工人，而编制只有医生和药剂师才有。而医院直签合同工一般是后勤部门的。而合同工属于企业性质的，虽然，医院里正式的劳动合同制工人，工作也比较稳定，待遇也不错。但是，和有编制的医生药剂师相比，还是有差距的。因为，医生药剂师毕竟是有编制的，属于体制内的，铁饭碗，待遇要远好于合同工的。这就是区别。
一、上级不同
1.省属事业编，上级为省属事业单位，是省政府领导的独立的一个事业单位。若是省直事业单位的上级是政府的一个部门，比如省质监局下属的产品质量检验所就是省直事业单位。
2.市属事业编，上级为市属事业单位，是市政府领导的独立的一个事业单位。市直事业单位道理和省直的一样， 层级一般省属的低，但也有例外，因为有的事业单位是垂直管理，而有的是属地化管理。
二、同事不同
1.省属事业编，同事里有些是公务员，编制为公务员与事业编制混合。
省事业单位是省直属事业单位，为事业编制。事业单位分为中央直属，省直属，市直属等等。
2.市属事业编，同事（包括领导和员工）也都是事业编制，没有公务员。
三、资金来源不同
1.省属事业编，省级单位是省政府或者各厅下属的，由省财政发工资。省属事业单位是有省级部门创立或者负责管理的事业单位。
2.市属事业编，市级事业单位是市政府或者各局下属的，由市财政发工资。而市属事业单位是市级部门创立或者负责管理的事业单位。
法律依据：国务院《事业单位人事管理条例》
第三条 中央事业单位人事综合管理部门负责全国事业单位人事综合管理工作。
县级以上地方各级事业单位人事综合管理部门负责本辖区事业单位人事综合管理工作。
事业单位主管部门具体负责所属事业单位人事管理工作。
第五条 国家建立事业单位岗位管理制度，明确岗位类别和等级。