1、孔雀鱼繁殖新品种需要做一些准备，母鱼在性成熟前做好分缸不接触公鱼，鱼龄1个半月能分出公母后马上分缸，直到养满2个半~3个月，挑选体型好，强壮品系特征明显的母鱼做为种母，选择成熟强壮相同品系的公鱼3~4条与种母合缸交配。公母最好为异地鱼，如近亲繁殖，3代以后，品系退化会非常严重。
2、避免3代以内的近亲繁殖，避免杂交，分缸饲养，超过三代就会出现退化，简单点说以孔雀鱼蓝草为例1：两地购鱼，在A和B代表地区，A公和B母繁殖，成为一线。A母和B公繁殖，成为另一线。如果缸多可以用子代与父母代进行繁殖，则又成为一线，如此以来两地购鱼后主人最少有4线鱼养，这样相互混杂繁殖，就能确保品系的良好维系。
3、例2：一地购鱼，A公与A母繁殖后产生a公a母。A公与a母繁殖成为一线，a公与A母繁殖又成一线。这样就有了两线鱼。两线互相杂交，这样才能确保品系的维系（一地购鱼还是有些缺陷）。
1、单独饲养：饲养者要想保证孔雀鱼品种的纯正性，最好将它们单独饲养。在繁殖的时候，也要选择同品种的孔雀鱼进行交配。繁殖出的小鱼也要分开喂养，这样可以避免它们自然繁殖。
2、饲养多条：虽然孔雀鱼同品种交配可以保证它们的纯正性，但是饲养者也不能让一对孔雀鱼一直繁殖。最好多样几条品种纯正的孔雀鱼，这样它们才能避免近亲繁殖导致基因退化的情况。但是纯种的孔雀鱼价格是比较高的，饲养者在养殖的时候需要悉心照顾，避免它们出现死亡的情况。
孔雀鱼养水的时间
新买的孔雀鱼下水前需要保持三周左右的水分。首先打开过滤器进水，投加硝化细菌。然后，每周换一两次水，每次换1/3。2 ~ 3周后，放几只孔雀鱼试种。