1.香味浓郁度不同。人工培植水芹细长，因为是高密度种植。吃上去很嫩，但是芹菜香味很淡；野生芹菜纤维度要高，而且芹香味浓郁。
2.茎的颜色不同。人工培植的水芹是白色茎，而西畔山洲的野生水芹茎杆底部呈自然的紫红色。
3.长度不同。水芹长度约人工种植水芹的1/3。
水芹菜可以通过以下三种方式进行存放：
1. 冰箱冷藏保存：首先，用保鲜膜包裹水芹菜，然后放入冰箱的冷藏室中保存一个星期左右。
2. 冷冻保存：先将水芹菜包裹好，然后放入冰箱的冷冻室中冷冻，可以保存几个月以上。
水芹和白芹虽然都属于芹菜的一种，但它们并不完全相同。水芹是生长在水中的芹菜，而白芹则是经过旱作培土软化栽培或避光栽培而来的，其茎部呈白色，口感更加脆嫩。白芹在我国江苏溧阳、南京等地种植较多，其中溧阳白芹还是农产品地理标志产品。因此，虽然水芹和白芹都属于芹菜，但它们的生长环境和栽培方法不同，口感和品质也有所差异。