根据传统的做法，三丝炒面豆芽的配料分为三丝（瘦肉丝、木耳丝和胡萝卜丝）和面条。通常，先将三丝爆炒熟透，再加入豆芽一起翻炒，将面条倒入锅中翻炒，最后加入调料翻炒均匀即可。因此，豆芽是在爆炒完三丝之后，面条入锅之前放入的。这个过程需要注意豆芽的烹饪时间，炒的时间不要太长，以免过度熟化影响口感。综上，三丝炒面豆芽最后放的是豆芽。
做法如下：
准备材料：公仔面、鸡蛋、青红椒、洋葱、罐头鱼、葱等。
煮面条：将公仔面放开水中煮至8成熟，然后过冷水待用。
煎鸡蛋：鸡蛋小火煎成薄薄的蛋饼，上碟后切成细条。
切丝：青红椒、洋葱、罐头鱼等材料切成细丝。
炒制：热锅后下油，先将鸡蛋丝炒至凝固后装碟备用。接着，将切好的蔬菜丝放入锅中炒熟，可加少许盐调味，然后装碟备用。
炒面条：将煮好的面条放入锅中翻炒至微微干身。
混合炒制：将炒好的蔬菜丝、鸡蛋丝等加入面条中，加入公仔面原味料、酱油等调味料，翻炒均匀。
加入麻油：最后加入适量的麻油，翻炒均匀后即可上碟。